易烧伤，生活中无法修复：伽玛刀在治疗过程中会灼伤皮肤表面的患者，因为烧伤组织瘢痕化并持续萎缩，刚性、患者无法进行自我修复，组织烧伤会继续进展，导致周围的非烧伤组织出现相应的反应。这是伽玛刀严重的副作用，是麻烦的一个。
杀伤力大，杀死正常细胞：伽玛刀属于放射性治疗，谁被框架在正常组织和肿瘤组织中的映射区，统一按杀害是没有错的，更大范围的映射，映射时间较长，对于正常组织的杀手也更大，尤其对重要器官的杀伤力是强大的。
治疗不彻底，易复发和转移：伽玛刀杀死藏在角落或隐匿的肿瘤，也不能将肿瘤细胞杀死，很容易引起肿瘤转移或复发。一般不到三个月的时间会引起复发，所以患者需要反复地接受大剂量的照射，对患者的身心造成很大的伤害，让很多患者感到疼痛。
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